挤搓式玉米种脱粒机的工作原理类似于人工手搓，在脱粒室内，带齿的滚筒转动使玉米棒做圆周运动,滚筒上的轴线为螺旋状，在转动时会将物料向排芯口以螺旋动作推动。带齿滚筒由螺旋冠狀齿和螺旋平板齿构成，运作时带动板齿运动。

滚筒上的螺旋冠状板齿工作原理犹如人工采用螺丝刀先将玉米棒上部分籽粒去除，再以挤搓的方式轻松脱除剩余籽粒。

机器内部通常情况下被物料填充，所以带齿轴转动时会对物料产生推送力，使其在受到推压的作用下与栅格凹板接触并做相对运动，以达到挤搓脱粒的效果。同时，由于空间挤压力，籽粒与籽粒之间也能充分得到挤搓，所以脱净率较高。